地衣芽孢桿菌（Bacillus licheniformis）和枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis）均為用途廣泛的菌種，兩者都能產(chǎn)生芽孢，處于一種休眠的狀態(tài)，免受外界環(huán)境對自身活性的影響，等條件符合時有能脫掉芽孢，成為活菌。但兩者生長情況不同，地衣比枯草要生長的慢些，培養(yǎng)的時間上要長些；兩者在產(chǎn)酶方面也有不同，枯草產(chǎn)淀粉酶和纖維素酶多點，地衣產(chǎn)蛋白酶多些。作用原理上都基本相同。在菌落、菌體形態(tài)上難以完全區(qū)分，在實踐中發(fā)現(xiàn)某些表型形狀可用于區(qū)分這兩種菌：

某些表型形狀的具體方法可參考微生物鑒定工具書。

需要注意的是，以上列舉的性質(zhì)不具有絕對性，某些菌株并不符合以上列舉的特性，例如目前已發(fā)現(xiàn)一些枯草芽孢桿菌的菌株可以在55℃下生長。因此鑒定一個可疑菌株時，最好通過16S rDNA序列來判斷是地衣芽孢桿菌還是枯草芽孢桿菌。